بدأت سلطات الاحتلال منذ عام 2002 بإنشاء جدار الفصل العنصري الذي بات يقضم شيئاً فشيئاً آلاف الدونمات من مختلف أراضي قرى ومدن الضفة الغربية، أما بالنسبة لدير إستيا فقد أصدرت سلطات الاحتلال بتاريخ 30 نيسان/ أبريل عام 2007 مخططاً يقتطع من أراضي البلدة ما تقدر مساحته بـ 18827 دونم من أراضي البلدة، أي ما تعادل نسبة 55% من مجمل المساحة التاريخية لأراضي البلدة. 

وبحسب بيانات وإحصائيات أصدرها معهد الابحاث التطبيقية- أريج فإن جدار الفصل العنصري هذا يخترق أراضي البلدة ويلتف حولها من جهات الشمال إلى الشمال الغربي ثم جنوباً وبطول يقدر بـ 7.5 كم.