بير إماعين في منتصف القرن السادس عشر الميلادي
إحدى الوثائق العثمانية الهامة  لقرية (بير إماعين ، بير معين) وهي مقدمة من مؤسسة إحياء التراث والبحوث الإسلامية في أبوديس والتابعة لوزارة الأوقاف والشؤون الدينية ، والوثيقة باللغة العثمانية القديمة قام بقراءتها كل من خبير قراءة الخط العثماني الاستاذ محمد الصفدي (أبو صبحي) عميد مؤسسة إحياء التراث والبحوث الإسلامية والاستاذة بسمة العباسي مديرة الوثائق في المؤسسة .

والوثيقة من كتاب الدفتر المفصل رقم (304) للواء غزة والرملة عام 1556م والموجود صورة عنه في مؤسسة إحياء التراث وجاءت الوثيقة في (14) سطر وفيها : أن قرية بير معين تتبع الرملة وهي وقف العمارة العامرة في القدس الشريف وبها أسماء أرباب الأسر دافعي ضريبة الزراعة وعددهم (49)رب أسرة ولكل صاحب أسرة خانة والخانة هي البيت المعمور ، أما أسماء أرباب الأسر هم :

محمد بن أحمد ، أحمد بن أحمد ، غانم بن سالم ، غنام بن سالم ، محمد بن إبراهيم ، حاج يحيى إبراهيم ، شاكر بن إبراهيم ، أوزبك بن عبيد ، علي بن بريك ، سيف بن أبو بكر ، صالح بن عثمان ، بدر بن سليمان ، سبع بن أحمد ، حسن بن عماد ، محمود بن حسن ، علي بن حسن ، أحمد بن محمود ، أحمد بن حميد ، خليفة بن حميد ، مخلوف بن حميد ، أحمد بن حمد الله ، أحمد بن حمدان ، حمد بن أحمد ، حمدان بن أحمد ، حسين بن علي ، علي بن حسين ، حسن بن حسين ، محمد بن حمدان ، عبيد بن محمد ، أحمد بن سيف ، موسى بن سيف ، محمد بن سيف ، إبراهيم بن سيف ، عواد بن عوض ، معاون بن عوض ، ، محمد بن عوض ، عمر بن عوض ، منصور بن عوض ، أحمد بن محمد ، غنيم بن سالم ، محمد بن حمدان ، خالد بن أوزبك ، صالح بن إبراهيم ، علي بن أحمد ، مصلح بن الراعي ، علي بن سوف ، عماد بن أحمد ، معمر بن عوض ، عبد الله بن محمد .

حاصلات القرية المذكورة قسم من الربع وقيمة الضرائب الزراعية هي : حنطة (2) غرارة (960) أقجة وشعير (1) غرارة (260) أقجة والسمسم (400) أقجة ومال صيفي مع خراج أشجار وثمن زيت وغيره (760) أقجة ورسم معصرة (24) أقجة ورسم معزة ونحل (93) أقجة ورسم باد هوى وعروس (50) أقجة  ومجموع الرسوم (2547) أقجة ، والأقجة عملة عثمانية مصنوعة من الفضة وكانت في بداية العهد العثماني قيمتها عالية .

بير إماعين (بير معين) عام 1596م
 جاء في كتاب : (الجغرافية التاريخية لفلسطين والأردن وجنوب سوريا) لمؤلفه القدير الاستاذ الدكتور كمال عبد الفتاح وزميله الدكتور هتروت أن قرية بير معين كانت تابعة ناحية الرملة لواء غزة وأراضيها زراعية خصبة وكانت تدفع (25% ) على ضريبة الزراعة خصوصاً الحنطة والشعير والأشجار المثمرة وبلغت الضريبة الزراعية على القرية في عام 1569م (3500) أقجة .

بير إماعين (بير معين) إحدى قرى وقف خاصكي سلطان
 أنشأت زوجة السلطان سليمان القانوني روكسيلانه عام 1551م تكية خاصكي سلطان في مدينة القدس الشريف مؤسسة خيرية لتقديم الطعام والشراب للفقراء وعابري السبيل والمجاورين وحبست على مصالحها أوقافاً غنية تعد من خيرة أراضي فلسطين ونظراً لاحباسها الواسعة واهتمام الدولة بها حتى تستمر في أداء رسالتها ظلت معمورة وتقوم بدورها خير قيام منذ تأسيسها وحتى نكبة عام 1948م وتجدد نشاطها قبل حوالي عشرين سنة وزادت القرى والمدن الموقوفة على التكية أكثر من مئة قرية ومدينة ومنها قرى ومدن كاملة مثل : مدينة اللد وقرى العباسية وكفر عانة ويازور وعنابة وخربثة ورنتيه والكنيسة وبير إماعين … إلخ .

بير إماعين (بير معين) ناحية نعلين
 كانت ولاية القدس مقسمة إلى تشكيلات إدارية في عهد الدولة العثمانية نضرب مثلاً ولاية القدس عام 1872م كانت مقسمة إلى ثلاث متصرفيات هي عكا والقدس ونابلس ومتصرفية القدس مقسمة إلى أربعة أقضية وهي قضاء يافا وقضاء القدس وقضاء الخليل وقضاء غزة ، وكان قضاء يافا مقسم إلى ثلاث نواحي هي : ناحية يافا وناحية اللد وناحية الرملة .

وفي عام 1904م قسمت متصرفية القدس إلى خمسة أقضية وهي يافا والخليل والقدس وغزة وبير السبع ، وقسمت يافا إلى :

1ـ ناحية الرملة ويتبعها عدد من القرى .

2ـ ناحية صفا ويتبعها القرى التالية : نعلين ، بير معين (بير إماعين) ، شقبه ، شبتين ، بلعين ، خربثة ، دير قديس ، المدية ، بيت نوبة ، البرج ، قبية ، بدرس ، برفيلية .

بير معين قبل سنة 1948

كانت القرية قائمة على أرض متعرّجة في طرف السفوح الغربية لجبال رام الله. وكانت طريق فرعية تصلها بطريق الرملة- رام الله العام (الذي كان يمر من الجهة الشمالية الشرقية للقرية. وكانت بير معين مبنية حول بئر قديمة تحمل الاسم نفسه. وقد سماها الصليبيون بيرمينين (Bermenayn) وجعلوها إقطاعة موقوفة لكنيسة القبر المقدس في القرن الثاني عشر للميلاد. يف سنة 1596، كانت بير معين قرية في ناحية الرملة (لواء غزة)، وعدد سكانها 165 نسمة. وكانت تؤدي الضرائب على عدد من الغلال كالقمح والشعير والزيتون والسمسم، بالإضافة إلى عناصر أخرى من الإنتاج والمستغَلات كالماعز وخلايا النحل ومعصرة كانت تستعمل لعصر الزيتون أو العنب.

في القرن التاسع عشر، وُصفت بير معين بأنها مزرعة صغيرة مبنية على مرتفع من الأرض. وفي العصور الحديثة كانت القرية مقسمة قسمين، شمالي وجنوبي، يفصل بينهما شارع مرصوف بالحجارة. وكان القسم الشمالي مستطيل الشكل، بينما كانت القسم الجنوبي على شكل نصف دائرة. وكانت المنازل مبنية بالحجارة والطين، وقد بُني الكثير منها في الأعوام الأخيرة من عهد الانتداب، ولا سيما في الجهة الشمالية الغربية.

كان سكان بير معين من المسلمين في معظمهم، لهم فيها مسجد وإلى جانبه مدرسة ابتدائية أُسست في سنة 1934. وكانت أراضي القرية غنية بالمياه الجوفية التي مكنت السكان من زرع غلال متنوعة، كالحبوب